原郑州牧业工程高等专科学校，1986年开办畜产品加工专业，1997年设立食品加工工艺专业，2003年更名为食品加工技术专业并成立食品工程系。2013年成功获批首批本科招生专业食品科学与工程专业。

原郑州牧业工程高等专科学校，2003年开办农产品质量检测专业，2008年成立质量检测与管理系，2014年成功获批本科专业食品质量与安全专业。

原郑州牧业工程高等专科学校，1997年开办发酵工艺专业，2001年设立生物技术专业，2006年成立生物工程系，2015年获批本科专业酿酒工程专业，2016年获批本科专业生物工程专业，2016年成立生物工程学院。

原河南商业高等专科学校，2004年开办烹饪专业，2009年设立食品加工技术专业，2011年设立食品营销专业，2011年成立食品系。

2013年郑州牧业工程高等专科学校与河南商业高等专科学校合并升本科，2015年食品工程系、质量检测与管理系、食品系合并成立食品工程学院。

2018年食品工程学院与生物工程学院合并成立食品与生物工程学院。同年成立酒业学院，与食品与生物工程学院合署办公，设置食品与生物工程学院（酒业学院）。